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病毒学档案（2022年）167卷：1467–1470页

DOI：10.1007/s00705-022-05446-2

注释序列记录

一种感染虫草真菌（Cordyceps chanhua）的新型交替病毒分子特征研究

张宇翔¹ · 石娜杰¹ · 王平¹ · 朱秋燕¹ · 杨国根² · 黄波¹

收稿日期：2021年12月7日

接受日期：2022年3月8日

在线发布日期：2022年4月12日

© 奥地利Springer-Verlag GmbH独家授权，Springer Nature集团2022年出版

摘要

本研究在中国虫草真菌（Cordyceps chanhua）中发现并鉴定了一种新型双链RNA（dsRNA）真菌病毒，命名为蝉花交替病毒1号（CcAV1）。其完整基因组由三条dsRNA片段组成：dsRNA 1（3,512 bp）、dsRNA 2（2,655 bp）、dsRNA 3（2,415 bp）。

每条dsRNA均含一个开放阅读框（ORF）：dsRNA 1编码RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp）、dsRNA 2和dsRNA 3分别编码假设蛋白1（HP1）和假设蛋白2（HP2）。

通过氨基酸序列比对，CcAV1的RdRp、HP1和HP2与Aspergillus foetidus dsRNA真菌病毒的同源性最高（分别为66.99%、49.30%和56.91%）。基于RdRp序列的最大似然系统发育树显示，CcAV1与**拟定的“交替病毒科”（Alternaviridae）**成员聚为一支。因此，我们提出CcAV1是该科的新成员。

背景

目前已知的真菌病毒多为dsRNA病毒，国际病毒分类委员会（ICTV）将其分为8科，而“交替病毒科”尚待正式批准。该科成员需具备至少3条dsRNA片段，其中最大片段编码RdRp。此前仅报道过4种潜在成员（如Alternaria alternata virus 1和Aspergillus foetidus virus）。

蝉花（Cordyceps chanhua）是中国传统药用及杀虫真菌，曾长期被误称为“蝉花拟青霉（Isaria cicadae）”。本研究从安徽采集的菌株RCEF6000中分离到两条病毒：一种双分病毒（partitivirus）和一种新型交替病毒（CcAV1）。

方法与结果

1、病毒鉴定

通过纤维素色谱法从菌丝中提取dsRNA，电泳显示5条条带（图1A）。

高通量测序和RT-PCR证实其中3条（dsRNA 1-3）属于CcAV1，另两条为双分病毒。

2、基因组特征

保守末端序列：三条dsRNA的5'端均含共同保守序列（图1C），3'端含23-46 nt的poly(A)尾。

编码蛋白：RdRp（126.41 kDa）含典型病毒聚合酶结构域，其活性中心为ADD（非典型GDD）。HP1和HP2功能未知，但与交替病毒科成员同源性显著。

3、系统发育分析

基于RdRp序列的进化树显示，CcAV1与Aspergillus foetidus virus等聚于交替病毒科分支（图2）。

结论

CcAV1是首个报道感染虫生真菌的交替病毒科成员，其基因组结构和保守基序符合该科特征。研究结果扩展了对真菌病毒多样性的认知，并为后续药用真菌病毒调控研究奠定基础。

数据可用性

基因组序列已提交至GenBank（登录号：OK481552-OK481554）。

补充材料

在线版本包含补充信息（访问DOI链接）。

基金与声明

基金：国家自然科学基金（32172473）和安徽省自然科学基金（1908085MC56）。

利益冲突：无。

伦理声明：本研究不涉及人类或动物实验。